大密度、大规模的弹劾，可以想象，毛文龙的日子很不好过。他多次上疏自辩：“为病变万难弥息，臣命万难保全等事疏：臣受数十疏捏谤以来，心如死灰！”
好一个心如死灰！可以说，朝中有人，再大的不法没人说，朝中无人，就算守法也不能幸免！
等到袁崇焕横空出世，他是进士出身，天生就看不起飞扬跋扈的武将（你要是象小颜这么会做人，老袁也就暂时放你一马，但要是放老袁巡抚福州，搞不好他也要斩了小颜），眼里揉不得沙子的袁崇焕有了“毛文龙可用就用，不可用就杀了他”的杀毛之心。
不过他也知道东江镇（皮岛）的重要性，而且颜大少连续来信，劝阻他说：“……顾虑日后，不可不慎！”
袁崇焕以阅兵为名，乘船到达皮岛，毛文龙前来会面。袁崇焕同他设宴饮酒、行乐，每每到半夜才罢，毛文龙没有觉察袁崇焕的意思。袁崇焕同他商量更改营制，设立监司（就是由朝廷派监军），毛文龙很不高兴。
袁崇焕用离职返乡劝说他，大概就是说：“你辛苦了，现在给个机会给你，你停职留薪，回家乡享福吧！”
毛文龙回答说：“以前有这个意思，但现在只有我了解东部战事，等东部战争完毕，朝鲜衰弱，可以一举而占有。”
听听，非你莫属，领导是最不喜欢听这种话！
最终袁崇焕以毛文龙犯了（不设监军、欺骗君主、侵占军粮、劫掠商船、强娶民女等）十二条大罪为由将其拿下，请出尚方宝剑，斩了毛文龙！
接着分拨毛文龙的士兵二万八千人为四协，任用毛文龙的儿子承祚、副将陈继盛、参将徐敷奏、游击刘光祚为首领。收回毛文龙的敕印、尚方宝剑，令继盛代他掌管。
袁回到宁远，把毛文龙一事上书报告皇帝，末尾说：“毛文龙作为大将，不是我可以擅自诛杀的，所以我谨席橐待罪。”
崇祯皇帝突然听到这个消息，大吃一惊，但想到毛文龙既已死去，当时又靠着袁崇焕，所以就以赞扬的态度下诏书褒奖他。
不久又传旨公开毛文龙的罪行，用以稳定袁崇焕的心。
毛文龙既去，朝中东林党弹冠相庆，而袁崇焕也是得意洋洋，自以为为国锄了大奸，整个中国只有一个明白人，远在东南地区的颜常武知道中国进入了多事之秋！
没有毛文龙的牵制，只怕皇太极即将入寇北平了！
历史存在着它的巨大惯性，不是你颜大少一个人所能螳臂挡车的！
颜常武站在窗前看着港口的战舰群，思索着他该怎么办！
不，既定的方针不能改！
他叫道：“来人！”
“是！”
“请陈和彬来！”
财政官陈和彬到达，惊讶听颜常武吩咐道：“立即去月港，贷款百万银元，再建六条战列舰，明年底我们乘西北风进攻巴达维亚！”
又一条命令是甘辉返回台湾，对于大陆之事，颜常武做起鸵鸟。
……
他想的是不管别人家里的事，没想到别人却记挂着他，确切的是北平的崇祯皇帝，准备搞台湾了。